微生物基因组学

视频:MetaSUB-世界城市的分子肖像

利用NGS绘制斯德哥尔摩地铁微生物群图

MetaSUB-世界城市的分子肖像
2017年6月13日

7月,斯德哥尔摩将举办第三届地铁和城市生物多样性宏基因组学和宏设计年会(MetaSUB),该年会将汇集致力于绘制全球67个城市城市宏基因组图谱的研究人员。


这个雄心勃勃的项目始于两年前,当时克里斯托弗·梅森教授和 他的团队,为纽约市创建了第一个基于表面的城市规模微生物组和宏基因组研究。利用DNA数据,该项目研究了这种“城市微生物群”如何随着天气、清洁度、建筑材料甚至社区社会经济水平等变量而变化。该团队试图在整个地铁系统中建立基线概况,识别潜在的生物威胁,并提供城市可以用来创建“智慧城市”的额外数据,即使用数据来改善城市规划、管理和人类健康的数据。值得注意的是,近一半(48%)的DNA测序结果与已知的生物体不匹配,这突显了乘客周围每天存在的庞大微生物群。


纽约地铁项目只是一个开始,它促成了一个国际实验室联盟的成立,以建立公共交通系统中微生物组的全球“DNA图谱”,足球外围投注APP-买球网站推荐是该项目的工业合作伙伴。

我们采访了斯德哥尔摩大学的Klas Udekwu,他正在瑞典领导研究足球外围投注APP-买球网站推荐的下一代测序如何使这项研究成为可能,并听取了他如何将该项目的范围扩大到非洲的尼日利亚。

 

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