微生物转录组和复转录组信息对于预测对特定抗生素的耐药性、了解宿主-病原体免疫相互作用、量化基因表达变化和跟踪疾病进展非常重要。细菌、病毒和其他微生物的下一代RNA测序(RNA-Seq)已成为分析转录组和复转录组信息的标准方法。
转录组是由生物体基因组编码的一组全面的RNA。转录组包括复杂样本中一组生物体编码的所有RNA。
细菌、病毒和其他微生物RNA-Seq实验能够注释和量化全面的微生物转录本。提取细胞RNA并转化为cDNA,用于制备测序文库。然后,序列读取被映射回参考基因组,提供外显子连接和剪接位点等特征的定性信息,以及可以在许多实验集中进行比较的定量转录数据。
与微阵列等基于杂交的方法不同,RNA-Seq能够对常见和新型转录物进行无偏见的链特异性鉴定。宽的动态范围使得在单个细菌、病毒或其他微生物RNA-Seq实验中能够自信地识别高表达和低表达。通过适用于自动化的简化工作流程,可以一次处理多个样本。
Ribo Zero Plus rRNA耗竭试剂盒在RNA-Seq之前去除rRNA,使您能够专注于转录组的高价值部分。本技术说明展示了微生物分离物和群落样本的rRNA耗竭性能,同时与之前的试剂盒版本进行了比较。
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