开源生物信息学工具列表

基因组生物信息学工具

用于下一代测序数据的开源软件

基因组学社区的软件工具

随着基因组进展速度的不断加快,研究界对新工具和知识共享的需求也在不断增加。在足球外围投注APP-买球网站推荐,我们相信合作在推进基因组学的可能性方面发挥着关键作用。

这就是为什么我们开发了各种生物信息学工具,并在开源软件共享平台Github上分享它们。通过这种方式,世界各地的研究人员可以不断地测试、迭代并与基因组社区共享更新。

这些开源生物信息学工具是免费的,可以在Github上获得。浏览下面的列表,找到满足您特定需求的工具。

特色开源生物信息学工具

赛勒斯

使用全基因组测序数据对药物代谢酶基因CYP2D6进行基因分型的工具。

ExpansionHunter

一种用于重复基因分型和检测重复扩增的工具。

段落

一套基于图的基因分型工具,专门针对短读测序数据中的结构变异进行了优化。

PrimateAI

一种用于对错义突变致病性进行分类的深度残差神经网络。

REViewer

一种用于在包含长重复扩增的基因组区域中可视化测序数据的计算方法。

SMN副本

SMN1和SMN2的拷贝号呼叫者,用于使用全基因组测序数据进行脊髓性肌萎缩症和携带者筛查研究。

拼接AI

一种基于深度学习的工具,用于识别剪接变体并预测剪接接头。

Strelka2小型变量调用器

一种快速、准确的小变异调用者,专为分析小队列中的种系变异和肿瘤/正常样本对中的体细胞变异而优化。

基因组分析流程改进

博德研究所和足球外围投注APP-买球网站推荐合作共同开发和改进基因组分析管道。博德研究所的Eric Banks强调了DRAGEN-GATK最佳实践管道的开发和融资。他还解释了开发团队如何评估管道的开源版本和许可版本之间的功能等效性。

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用户友好的商业生物信息学软件工具

DRAGEN生物信息技术平台

为各种应用提供准确、超快速的测序数据二次基因组分析。

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BaseSpace序列中心

数据管理和简化的生物信息学,适用于实验室起步和快速扩展下一代测序操作。

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足球外围投注APP-买球网站推荐互联分析

一个模块化、安全的数据平台,用于可扩展的多组学数据管理、分析和探索。

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生物信息学管道设置

我们提供各种资源和信息,以帮助简化设置信息基础设施和数据分析管道的过程。

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我们的测序数据分析软件可帮助您花更多时间进行研究,减少配置和运行分析工作流程的时间。

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