足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA富集制备

一个快速、集成的工作流程,用于从各种样本类型和RNA输入量中生成富集和索引的测序文库。

<9小时

检测时间

<2小时

动手时间

10个RNA;20 ng FFPE RNA

输入数量

详见规格表

概述

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment使用珠上标记,然后是一个简化的90分钟杂交步骤,为RNA测序(RNA-Seq)应用提供了一种非常快速的解决方案。 

快速、简单、可扩展的工作流程

用不到两个小时的动手时间,在不到九个小时的总时间内准备和丰富序列就绪库。与足球外围投注APP-买球网站推荐高通量测序仪结合使用,每次运行可获得更多样本。

来自困难样本的高质量数据

能够从有限的起始材料和受损或降解的样本(如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织)中提供可重复的结果。

经济实惠且全面的RNA-Seq

在测序深度的一小部分上最大限度地提高发现能力。足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment旨在提供卓越的捕获效率和覆盖均匀性,最大限度地减少所需的测序深度,实现无偏差的准确检测。

灵活的模块化面板设计

使用各种预构建、验证的探针或定制探针检测和发现等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛查等,以获得最大的灵活性。


规格


所需产品

完整的RNA制备富集工作流程需要使用文库制备、探针面板和索引适配器(所有项目均单独出售)。

可选组件包括:

  • 足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA快速Hyb富集——包括富集试剂,仅适用于以与推荐不同的复杂度进行处理的客户

  • 足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备,(L)标记——包括预富集试剂,仅适用于以与推荐不同的复杂度加工的客户

/ 结果

应用

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment可在制备靶向测序文库时灵活选择样品类型和RNA输入量,用于支持检测和发现研究的各种RNA-Seq应用,如等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛选等。

工作流程示例


项目建议

仪器仪表 推荐样本数量 读取长度
NextSeq 550系统

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集+外显子组面板

中等产量:5

高输出:16

(基于每个样本25M的读数)

2×100 bp

NextSeq 1000系统、NextSeq 2000系统

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集+外显子组面板

第2页:16

第3页:48

(基于每个样本25M的读数)

2×100 bp

NovaSeq 6000系统

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集+外显子组面板

SP:32

S1:64

秒2:164

S4:384

(基于每个样本25M的读数)

2×100 bp

MiSeq系统

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集+病毒监测小组或泛冠状病毒小组

最多25个样本(基于每个样本1M的读数)

2×150 bp

NextSeq 550系统

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集+病毒监测小组或泛冠状病毒小组

最多384个样本(基于每个样本1M的读数)

2×150 bp



相关应用和方法

文档

产品文献

比较

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA富集制备 TruSeq RNA外显子组 足球外围投注APP-买球网站推荐绞合mRNA制备
检测时间 <9小时 约2天 6.5小时
自动化能力 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
内容规范 与足球外围投注APP-买球网站推荐外显子组面板一起使用时捕获编码转录组 捕获编码转录组/RNA外显子组 利用链信息捕获编码转录组
说明 一种可重复、经济的解决方案,能够从广泛的样本类型和输入中进行靶向转录检测和发现,包括福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本 为研究人员提供了一个清晰、全面的编码转录组视图,具有精确的链信息和减少的样本输入要求。 一种简单、经济高效的解决方案,用于分析具有精确链信息的编码转录组
动手时间 <2小时 约11小时 <3小时
输入数量 10个RNA;20 ng FFPE RNA 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA,或来自FFPE样本的20 ng总RNA 25-1000ng标准质量总RNA
仪器仪表 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq系统, NovaSeq 6000系统 NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X系统, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus系统 NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NovaSeq X系统, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus系统
作用机制 珠链转座子 靶向编码RNA的生物素化捕获探针。不需要具有多A尾的RNA。 PolyA捕获、基于连接的适配器和索引添加
方法 mRNA测序, 靶向RNA测序, 目标富集 外显子组测序, mRNA测序 mRNA测序
多路复用 最多384个唯一双索引(UDI) 最多24个单,96个组合(CD)双 最多384个唯一双索引(UDI)
核酸类型 RNA RNA RNA
专业样品类型 血液、低输入样本、FFPE组织 低输入样本,FFPE组织 不兼容FFPE,低输入样本
物种分类 人类,病毒 人类 哺乳动物、牛、小鼠、人、大鼠
链特异性 非搁浅 搁浅 搁浅
技术 测序 测序 测序
变量类 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、新转录本、转录变体 单核苷酸多态性(SNPs)、新转录本、转录变体 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、新转录本、转录变体

选择工具:

数字

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment提供快速的工作流程

与TruSeq RNA外显子组相比,珠上标记和一个90分钟的杂交步骤相结合,以更少的步骤提供更快的工作流程。

低输入样本的高质量数据

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment实现了来自通用人类参考(UHR)的10ng和100ng总RNA输入量之间的高度数据一致性。

低输入样本中BCR-ABL1基因融合的检测

使用足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichment和足球外围投注APP-买球网站推荐 Exome Panel从K-562细胞系制备的10ng RNA文库成功检测到BCR-ABL1基因融合。顶部比对轨道显示所有读数,底部轨道仅显示支持BCR-ABL1融合基因的读数。

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备浓缩液对编码区的覆盖

使用足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集和足球外围投注APP-买球网站推荐外显子组面板从10 ng UHR RNA和20 ng FFPE RNA制备的文库显示,超过85%的生成数据与编码转录本和UTR对齐。显示来自TruSeq RNA外显子库的数据以供比较。

低输入和FFPE样本的基因融合检测

在K-562细胞系(RNA完整性数,RIN=7.4,DV200=90%)和结直肠癌癌症细胞系(RIN=2.5,DV200=85%)的六个重复中,BCR-ABL1和TPM3-NTRK1基因融合的100%呼叫率。

聚变(源) RNA输入 检测
BCR-ABL 1(K-562) 7.4 10纳克 6/6个重复(100%)
TPM3-NTRK1(癌症) 2.5 20纳克 6/6个重复(100%)

资源

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图书馆准备(2)

足球外围投注APP-买球网站推荐®RNA制备富集(L)标记(16个样本)

20040536

包括用于制备和富集16个文库的试剂(16,1-多重富集反应)。单独购买富集探头面板、净化珠和索引适配器。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®RNA制备富集(L)标记(96个样本)

20040537

包括用于制备和富集96个文库的试剂(32,3-复合物富集反应)。单独购买富集探头面板、净化珠和索引适配器。

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索引适配器(8)

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)

20091654

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)

20091656

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)

20091658

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)

20091660

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)

20027213

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)

20027214

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)

20042666

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)

20042667

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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面板()

足球外围投注APP-买球网站推荐外显子组面板——仅限富集低聚物

20020183

当与足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep with enrichment配对时,足以进行8次富集反应,当与TruSeq RNA Exome配对时,可进行12次反应,当和足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with Enrichion配对时,可以进行32次反应。分别购买文库制备和富集试剂以及索引适配器。

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呼吸道病毒寡聚物面板V2

20044311

当与足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep with enrichment(96个样本)试剂盒配对时,足以进行32次3重富集反应。单独购买库准备和丰富工具包以及索引适配器。

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病毒监测小组,RUO 96 Rxns

20088154

包括病毒监测面板,当与足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep和富集试剂盒配对时,足以进行32次3重富集反应。单独购买库准备和丰富工具包以及索引适配器。

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泛冠状病毒专家组,RUO 96 Rxns

20088155

包括病毒监测面板,当与足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep和富集试剂盒配对时,足以进行32次3重富集反应。单独购买库准备和丰富工具包以及索引适配器。

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服务项目(1)

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA浓缩制备-客户现场

20044763

对足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备浓缩试剂盒进行为期2天的现场培训。实践培训包括RNA输入的量化以及最佳实践、故障排除技巧,以及针对应用程序工作流程的足球外围投注APP-买球网站推荐支持的分析工具的培训。

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配件产品(2)

足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA快速Hyb富集(16个样本)

20040540

包括足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA Prep的快速杂交富集试剂和富集试剂盒,用于16,1-复数富集反应。支持客户以与建议不同的复杂度进行处理。不包括预富集试剂。如需完整的浓缩制备,请订购足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA浓缩制备试剂盒。

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足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备,(L)标记(16个样本)

20040542

包括足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备富集试剂盒中的预富集模块,适用于16个文库。支持客户以与建议不同的复杂度进行处理。不包括浓缩试剂和纯化珠。如需完整的浓缩制备,请订购足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA浓缩制备试剂盒。

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FAQs

足球外围投注APP-买球网站推荐建议使用安捷伦科技通用人类参考RNA(UHR)(目录号740000)作为阳性对照样品。

足球外围投注APP-买球网站推荐外显子组、呼吸道病毒寡聚物组V2、病毒监测组和泛冠状病毒组可与足球外围投注APP-买球网站推荐 RNA制备和富集试剂盒一起使用。

eBLTL是一种富集的珠链转座子,通过在单个快速反应步骤中片段化和添加适配器标签序列来标记cDNA。

16反应试剂盒支持1倍工作流程,而96反应试剂盒则支持3倍工作流程。可以将其他附件产品添加到任一工作流程中,以与推荐的复杂程度不同的方式进行处理。
/ 结果

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优化的试剂盒提供了更高的簇密度和读取长度,与早期版本相比提高了测序质量分数。

TruSight肿瘤学500

通过一个大型泛癌面板启用CGP,该面板涵盖所有主要变体类别以及FFPE组织的基因签名(TMB、MSI和HRD)。

照亮DNA制备

一个快速、集成的工作流程,用于准备在各种测序应用中使用的库。

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