足球外围投注APP-买球网站推荐 DRAGEN二次分析订购

通过DRAGEN二次分析最大限度地了解基因组,了解最新更新,阅读常见问题解答,并找到产品支持。

此产品仅在特定地点有售。拜托 选择您希望此产品运送的位置 查看可用性。

概述

DRAGEN二次分析是一个功能强大的生物信息学软件套件,使各种规模的实验室能够对其基因组数据进行更多处理。 

主要特点

  • 分析来自任何具有本地或云部署选项的足球外围投注APP-买球网站推荐测序系统的NGS数据

  • 使用DRAGEN v4.3在约34分钟内完全处理40×全人类基因组,调用各种变体(SNV、indel、CNV、SV、镶嵌变体、星形等位基因等),而使用传统的开源解决方案需要8小时才能调用较少的变体类型

  • 使用DRAGEN原始读取存档(ORA)将FASTQ文件大小减小5倍

  • 通过多基因组(图)参考基因组和机器学习实现前所未有的准确性

克服基因组分析中的挑战

高度可扩展的DRAGEN分析解决了漫长的计算时间和海量数据集,而不会影响准确性或需要对生物信息学基础设施进行大量投资。可重构现场可编程门阵列技术(FPGA)提供了各种分析算法的硬件加速实现。

访问广泛的应用程序和管道

DRAGEN应用程序和管道可通过以下方式在安全、合规的云环境中使用 足球外围投注APP-买球网站推荐互联分析BaseSpace序列中心。通过本地服务器和NextSeq 1000系统、NextSeq 2000系统和NovaSeq X系统,也可以选择管道。

使用以下工具将DRAGEN分析管道与体细胞肿瘤学变体解释无缝集成 内部互联洞察 通过DRAGEN服务器。


规格


软件更新

DRAGEN v4.3现已在本地和云端提供

  • 下一代多基因映射器,整合了数百个高质量的参考样本,提高了变异调用的准确性,减少了种族偏见

  • 由专门的机器学习模型驱动的新的集成马赛克变体调用者,用于检测低等位基因频率的马赛克变体

  • 新的专业呼叫者-多区域联合检测(MRJD)呼叫者,用于在具有挑战性的节段重复区域对PMS2、SMN1、SMN2、STRC、NEB、TTN、IKBKG等医学相关基因进行基因分型

  • 扩展了ORA压缩能力,以支持人类甲基化数据和非人类数据

DRAGEN v4.2现已在NextSeq 1000和NextSeq 2000系列上提供:

  • 增强的多基因组(图)参考和机器学习(ML)模型提高了变体调用的准确性

  • 利用新的靶向呼叫者和星形等位基因呼叫者进行精确的PGx基因分型

  • 全面覆盖,扩展重复扩增目录,增加对性染色体低等位基因频率变异的支持,增强批量rna质量控制指标

NovaSeq X系列板载DRAGEN v4.1

  • 通过原始读取档案(ORA)提供变体调用和高达5倍的无损数据压缩

  • 并行运行多个二次分析管道

  • 包括BCL转化、种系、RNA、富集、体细胞和甲基化应用选项

应用

DRAGEN二次分析应用程序在单个平台上为许多实验类型提供了全面的覆盖,包括全基因组测序、外显子组测序、单细胞RNA-Seq和甲基化分析。

NGS分析软件解决方案

1
门诊化验室
2
快跑
3
分析

DRAGEN二次分析
准确、全面、高效地分析NGS数据。

洞察力

相关应用和方法

DRAGEN的主要应用和可用性

应用程序 DRAGEN本地服务器 NovaSeq X系列 NextSeq 1000/2000 BaseSpace序列中心 足球外围投注APP-买球网站推荐互联分析
BCL转换
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仅限自定义
DRAGEN NOW压缩
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仅限自定义
DRAGEN FASTQ+MultiQC
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全基因组 种系+体细胞 种系+体细胞(仅肿瘤) 仅限种系 种系+体细胞 种系+体细胞
丰富(包括外显子组) 种系+体细胞 种系+体细胞 种系+体细胞 种系+体细胞 种系+体细胞
DRAGEN放大器
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  仅DNA
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RNA
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单细胞RNA
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NanoString GeoMx NGS(空间转录组学)    
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甲基化
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基因组      
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冠状病毒 新冠肺炎序列,新冠肺炎谱系   COVIDSeq(仅限云) 新冠肺炎序列,新冠肺炎谱系  
TruSight肿瘤学500
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ScATAC-Seq(转座酶可及染色质的单细胞测序分析)
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推测
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PGx Star Allele呼叫者
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足球外围投注APP-买球网站推荐完成长篇阅读      
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RPIP和UPIP面板 贝塔    
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贝塔

*Kmer分类器支持的宏基因组学应用。更多工具即将推出。

核心DRAGEN版本因平台而异。请与当地代表联系以获取更多信息。

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管道 说明 检测到变体类型 提供的指标
DRAGEN多路分解 执行NGS分析的快速解复用 不适用 不适用
DRAGEN NOW压缩 针对FASTQ文件的高压缩比以及快速压缩和解压缩进行了优化,同时保持了数据完整性。 不适用
  • 压缩比
  • 运行时间
DRAGEN地图+对齐 可以独立运行,也可以作为DRAGEN管道套件的一部分运行 不适用
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
DRAGEN生殖系 提供端到端的NGS分析,包括先进的误差模型校准以提高准确性,以及通过足球外围投注APP-买球网站推荐 expansion Hunter进行重复扩增检测和基因分型。
  • SNV
  • 英德尔
  • CNV
  • SV
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN躯体 包括仅肿瘤和肿瘤正常模式,旨在检测肿瘤样本中的体细胞变异。这两种模式都没有倍性假设,能够检测到低频等位基因。
  • SNV
  • 英德尔
  • CNV
  • SV
  • TMB
  • MSI
  • HLA
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN富集 将DRAGEN的种系和体细胞呼叫者组合到专门用于分析富集样本的管道中。包括一整套丰富指标和报告。
  • SNV
  • 英德尔
  • CNV
  • SV
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
龙核糖核酸 执行转录组分析,从剪接接头发现和比对开始,然后进行快速比对、剪接接头作图和定量。(对于微分表达式,请尝试BaseSpace Sequence Hub上的DRAGEN微分表达式应用程序)。
  • 基因融合
  • SNV
  • 英德尔
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN单细胞RNA 执行解复用、细胞条形码和UMI纠错、序列比对和基因表达定量。 不适用
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 可调用性报告
  • 细胞指标
DRAGEN联合基因分型 在多个基因组中联合调用变体,并以极快的速度和毫不妥协的准确性扩展到大量样本。
  • SNV
  • 英德尔
  • CNV
  • SV
  • 重复扩张
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN甲基化 执行对齐和甲基调用。计算比对和甲基化指标。 不适用
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN参考生成器 接受FASTA文件,并构建DRAGEN应用程序使用的专有参考。 不适用 不适用
DRAGEN TruSight肿瘤学500 ctDNA分析软件 为TruSight肿瘤学500 ctDNA提供二次分析支持。仅在本地DRAGEN服务器(版本3)上可用。
  • SNV
  • 英德尔
  • CNV
  • DNA融合
  • MSI
  • TMB
  • 映射指标
  • 持续时间指标
  • 覆盖指标
  • 变量度量
  • 可调用性报告
DRAGEN杂质 在端到端的用户友好工具中实现可扩展的低通全基因组测序分析。
  • SNV
  • 英德尔
不适用
/ 结果

计划和定价

DRAGEN二次分析需要为本地服务器购买一年的许可证。所有许可证类型都有五个级别,吞吐量从100000 GB(级别1)到2000000 GB(级别5)不等。 

购买足球外围投注APP-买球网站推荐测序系统时,包括DRAGEN许可证和车载硬件。如果通过以下方式在云端部署DRAGEN BaseSpace序列中心足球外围投注APP-买球网站推荐互联分析,您需要购买年度订阅以及额外的 iCredits 存储和分析您的数据。

文档

产品文献

数字

DRAGEN管道的灵活性

DRAGEN分析提供了插入各种输入文件和生成一系列输出文档的灵活性。用户可以定制他们的体验,使用和生成他们想要的文件格式。每个管道的实际步骤各不相同。

绘制多平台可访问性

多平台可访问性

DRAGEN分析管道接入选项,其功能旨在满足每个实验室的NGS分析需求。

dragen on basespace序列中心

足球外围投注APP-买球网站推荐云平台的DRAGEN分析

DRAGEN分析足球外围投注APP-买球网站推荐互联分析 将DRAGEN二次分析的准确性和速度与定制分析管道的能力相结合,以在安全平台上操作信息学。

DRAGEN分析BaseSpace序列中心通过直观易用的界面提供按钮分析功能,并具有BaseSpace Sequence Hub的安全合规性和数据存储功能。

探索示例数据集

请参阅BaseSpace Sequence Hub中各种方法的示例数据集,或测试感兴趣的DRAGEN二次分析应用程序并交互式评估结果。在页面内搜索“dragen”一词,查看dragen分析的特定数据。

查看示例数据集

资源

Thumbnail

满足足球外围投注APP-买球网站推荐 DRAGEN二次分析

DRAGEN提供准确、全面、高效的NGS数据二次分析。

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NGS开创猫科动物遗传学

Zoetis公司Basepaws利用DRAGEN二次分析开发直接面向消费者的DNA试剂盒,为猫主人提供有关宠物健康的见解。

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Kazusa DNA研究所:DRAGEN如何缩短复杂植物基因组的分析时间

Sachiko Isobe博士分享了DRAGEN二次分析如何在传统方法的1/40时间内完成大型植物基因组的分析。

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澳大利亚的考拉保护计划使用全基因组测序来拯救物种

悉尼大学的研究人员使用DRAGEN分析为稀有和濒危物种的WGS提供动力,为保护计划提供信息。

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GeneDx:通过DRAGEN实现运营增长

GeneDx首席创新官Kyle Retterer详细介绍了他的公司如何将DRAGEN服务器无缝集成到其现有的本地解决方案中,以降低成本并缩短周转时间。

两个DRAGEN帮助Cardio CARE处理1 PB的数据,以更好地了解汉堡的心脏病。

足球外围投注APP-买球网站推荐 DRAGEN服务器v4

20051343

包括第一年的Avance Exchange支持。需要购买年度DRAGEN许可证。

登录以添加到购物车或查看定价。

标价:

折扣:

DRAGEN服务器1级1年许可证

20060397

DRAGEN服务器上的吞吐量为100000 Gb

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请求定价

标价:

折扣:

DRAGEN服务器2级1年许可证

20060398

DRAGEN服务器上的吞吐量为250000 Gb

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标价:

折扣:

DRAGEN服务器3级1年许可证

20060399

DRAGEN服务器上的吞吐量为500000 Gb

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折扣:

DRAGEN服务器4级1年许可证

20060400

DRAGEN服务器上1000000 Gb的吞吐量

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折扣:

DRAGEN服务器5级1年许可证

20060401

DRAGEN服务器上的吞吐量为2000000 Gb

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折扣:

显示 属于

选择摘要

产品中心

数量

单价

常见问题解答

DRAGEN通过各种最先进的技术,包括多基因组参考和机器学习算法,实现了高精度。有关详细信息,请查看 种系小变体调用的准确性提高 技术说明。

DRAGEN分析使用高度可重构的现场可编程门阵列(FPGA)来提供基因组分析算法的硬件加速实现。这些算法被实现为逻辑电路,提供几乎瞬时的输出。FPGA可以并行执行操作,因此不像基于CPU的系统那样依赖于节点。

否,DRAGEN分析只能在DRAGEN服务器上运行。用户还获得了独立的许可证,将其许可证的使用与特定的服务器联系起来。

BaseSpace Sequence Hub DRAGEN应用程序模拟了现场DRAGEN服务器上的管道,并应产生与现场管道相同的结果(与应用程序软件版本相同)。但是,现场DRAGEN服务器上可用的某些管道和软件版本可能无法作为BaseSpace DRAGEN应用程序提供。根据需要,努力将现场管道作为BaseSpace DRAGEN应用程序发布。

DRAGEN分析可在现场、托管或通过物理和基于云的DRAGEN系统之间的安全数据传输作为两者的混合使用。混合解决方案为用户提供了在需要更高分析能力时扩展云中工作流程的灵活性。

DRAGEN分析系统一次只能由一个用户使用。处理多个用户的最佳方法是使用作业排队工具,该工具可以接受来自用户的作业,并将其排队以供DRAGEN软件处理。该工具将一次调用DRAGEN软件一个作业,然后在作业完成时通知用户。DRAGEN分析与Slurm或LSF(负载共享设施)调度器配合使用,可以很好地管理多个用户。

对于现场和云分析,DRAGEN使用所有可用的FPGA和CPU资源一次处理一个样本。通常,运行时间非常快,单个DRAGEN服务器可以轻松跟上NovaSeq 6000系统的运行。对于使用许多NovaSeq 6000系统进行大规模WGS处理,您可能需要额外的DRAGEN服务器。您还可以在云中并行调度多个DRAGEN实例,每个实例处理一个样本。

目前,DRAGEN-on仪器可与NextSeq 1000/2000和NovaSeq X一起使用,不需要额外的许可证。机载应用程序和功能是特定于仪器的,与机载可用的不同。请参阅申请表以了解更多详细信息。

/ 结果

订购NovaSeq X系列

先进的化学、光学和信息学相结合,可提供卓越的速度和数据质量、出色的吞吐量和可扩展性。

MiSeq试剂盒v3

优化的试剂盒提供了更高的簇密度和读取长度,与早期版本相比提高了测序质量分数。

TruSight肿瘤学500

通过一个大型泛癌面板启用CGP,该面板涵盖所有主要变体类别以及FFPE组织的基因签名(TMB、MSI和HRD)。

照亮DNA制备

一个快速、集成的工作流程,用于准备在各种测序应用中使用的库。

工具书类

  1. 米勒NA、法罗EG、吉布森M等人。 用于遗传病应急管理的26小时高灵敏度全基因组测序系统。 基因组医学. 2015;7:100.电话:10.1186/13073-015-0221-8
  2. 照明。DRAGEN为PrecisionFDA基准数据的数据准确性设定了新的标准。通过足球外围投注APP-买球网站推荐机器学习和DRAGEN图优化变量调用性能。 /科学/基因组学研究/文章/龙之又一次精确fda-truth-challenge-v2.html。访问日期为2023年3月22日。

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