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COVIDSeq检测（96个样本）

这种中低通量的NGS检测使任何规模的实验室都能识别和跟踪新型严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型变体的出现和流行情况。

概述

COVIDSEQ检测（96个样本）是一种全面的基于扩增子的下一代测序（NGS）检测，旨在帮助研究实验室识别新的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型变体。 

  • 使用ARTIC v3引物检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型RNA的基因组

  • 当检测到≥90个扩增子时，报告共识序列

  • 支持无缝灵活的端到端工作流程

快速、经济高效的测序

COVIDSeq检测（96个样本）旨在运行少量样本，提供了一种低通量配置，非常适合足球外围投注APP-买球网站推荐台式测序系统，使较小的实验室能够对新变种进行分散监测。

统一的基因组覆盖率

报道的重点是刺突蛋白基因座。对于详细的测序，可选的ARTIC v4引物池提供了新变体的深入表征。

集成解决方案

试剂盒包括用于cDNA转化、扩增和文库制备的所有试剂。PCR过程中63°C的退火温度提高了变异分析和洞察力。

简化数据分析

使用开放软件工具评估谱系并注释突变，包括BaseSpace Sequence Hub中的DRAGEN COVID谱系应用程序。

规格

自动化能力 液体处理机器人
自动化详细信息 探索可用的自动化方法
内容规范 刺突蛋白基因座的病毒基因组覆盖率一致
说明 COVIDSeq检测（96个样本）是一种中低通量的NGS检测，旨在在任何足球外围投注APP-买球网站推荐台式测序系统上进行研究应用。
仪器仪表 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NextSeq 550Dx处于研究模式, NovaSeq 6000Dx处于研究模式, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统
方法 Amplicon测序, 靶向RNA测序
多路复用 iSeq系统上的8-plex 30-48 plex MiSeq系统上的48plex MiniSeq系统
核酸类型 RNA
样本类型详细信息 鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本
物种分类 人类，病毒
物种详细信息 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型
链特异性 非搁浅
技术 测序

所需产品

需要一次COVIDSeq检测（96个样本）。有四个选项可供选择，除了附带的索引板外，其他选项都是相同的。 

COVIDSeq阳性对照是可选产品。

足球外围投注APP-买球网站推荐 COVIDSeq v4引物池384样本RUO是v3引物池的可选替代品。v4针对德尔塔和奥密克戎变异株中的额外突变进行了更新，并提高了刺突蛋白基因座的覆盖率。

/ 结果

应用

COVIDSeq检测（96个样本）使实验室能够使用台式测序系统对严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型变体和谱系进行基因组监测，以识别和监测新菌株。

工作流程示例

1
准备

足球外围投注APP-买球网站推荐 COVIDSeq检测（96个样本）

2
序列
3
分析

应用说明

使用足球外围投注APP-买球网站推荐 COVIDSeq测试的新冠肺炎监测测序指南（RUO版本）

相关应用和方法

冠状病毒测序

NGS可以识别新型冠状病毒变种，追踪新冠肺炎传播等。比较各种冠状病毒测序目标的NGS方法。

基因组监测

NGS通过鉴定新型冠状病毒和其他新兴传染病病原体来支持有效的基因组监测策略。

公共卫生监测

基因组学可以通过检测和表征新的、新兴的和循环的病原体来促进公共卫生和健康。

文档

产品文献
  • 技术说明 PDF<1 MB
    3个版本
  • 技术说明 PDF 1 MB
    2个版本
支持文档

比较

COVIDSeq检测（96个样本） COVIDSeq测试（RUO版本） 呼吸道病原体ID/AMR富集试剂盒 泛冠状病毒专家组
自动化能力 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
自动化详细信息 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
内容规范 刺突蛋白基因座的病毒基因组覆盖率一致 刺突蛋白基因座的病毒基因组覆盖率一致 同时检测呼吸道病原体DNA和RNA，并同时分析抗菌药物耐药性（AMR）基因表达。
说明 COVIDSeq检测（96个样本）是一种中低通量的NGS检测，旨在在任何足球外围投注APP-买球网站推荐台式测序系统上进行研究应用。 COVIDSeq检测（RUO版本）是一种可扩展的高通量NGS检测（最多3072个样本），旨在用于研究应用。   识别呼吸道感染和合并感染，检测抗菌药物耐药性标志物，并对关键病原体（严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型和流感A/B型病毒）进行菌株分型，以研究病毒的进化和传播。 泛冠状病毒小组是综合工作流程的一部分，该工作流程允许对各种动物宿主中的200多种已知和新型冠状病毒毒株进行检测和全基因组测序。
仪器仪表 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NextSeq 550Dx处于研究模式, NovaSeq 6000Dx处于研究模式, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NextSeq 550Dx处于研究模式, NovaSeq 6000Dx处于研究模式, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统 MiSeq系统, NextSeq 550系统, MiniSeq系统 MiSeq系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq系统
方法 Amplicon测序, 靶向RNA测序 Amplicon测序, 靶向RNA测序 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 目标富集 全基因组测序, 目标富集
多路复用 iSeq系统上的8-plex 30-48 plex MiSeq系统上的48plex MiniSeq系统 NextSeq上的384个复数 单次运行最多384个样本，具有独特的双索引 单次运行最多384个样本，具有独特的双索引
核酸类型 RNA RNA DNA、RNA RNA
样本类型详细信息 鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本 鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本
物种分类 人类，病毒 人类，病毒 真菌、病毒、细菌 病毒
物种详细信息 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型 检测呼吸道病原体（180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒，包括严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型）和抗菌素耐药性等位基因（1200多种）。
链特异性 非搁浅 非搁浅 非搁浅
技术 测序 测序 测序 测序

选择工具：

库准备和阵列套件选择器

根据您的需求找到合适的测序库制备试剂盒或微阵列。按方法、种类等过滤。比较、共享和订购工具包。

数字

基因组覆盖性能

与单次读取相比，成对端读取的热图绘制性能随读取长度和深度的变化显示出显著的改善。显示了置信度大于0.99的基因组分数，接近1的值表示严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型基因组的更完整覆盖。

图书馆准备(4 )

COVIDSeq检测（96个样本）索引1

20049393

包括用于制备96个样本以检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的试剂。包括带有96个独特双索引的索引板1。分别购买可选的阳性对照和可选的v4引物池

登录以添加到购物车或查看定价。

标价：

折扣：

COVIDSeq检测（96个样本）指数2

20051772

包括用于制备96个样本以检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的试剂。包括带有96个独特双索引的索引板2。分别购买可选的阳性对照和可选的v4引物池

登录以添加到购物车或查看定价。

标价：

折扣：

COVIDSeq检测（96个样本）指数3 RUO

20051773

包括用于制备96个样本以检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的试剂。包括带有96个独特双索引的索引板3。分别购买可选的阳性对照和可选的v4引物池

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标价：

折扣：

COVIDSeq检测（96个样本）指数4 RUO

20051774

包括用于制备96个样本以检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的试剂。包括带有96个独特双索引的索引板4。分别购买可选的阳性对照和可选的v4引物池

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配件产品(2)

COVIDSeq阳性对照

20051775

包括100 uL COVIDSeq阳性对照，以支持质量控制

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足球外围投注APP-买球网站推荐 COVIDSeq v4底漆池，384个样品RUO

20065135

包括可选的ARTIC v4引物池试剂，最多可容纳384个样本。替换COVIDSeq测试（RUO）和COVIDSq检测（96个样本）中包含的v3引物池。

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FAQs

主要区别在于每次检测可以运行的样本数量。COVIDSeq检测（96个样本）在足球外围投注APP-买球网站推荐台式测序系统上运行多达96个样本，以适应较小的研究实验室。相比之下，COVIDSeq测试（RUO）在NovaSeq 6000系统或NextSeq测序系统上运行了多达3072个样本。

制备的文库可以在任何足球外围投注APP-买球网站推荐测序系统上测序。然而，COVIDSeq Assay（96）样品的低通量配置非常适合足球外围投注APP-买球网站推荐台式测序系统，包括iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、NextSeq 550、NextSex 1000和NextSeq 2000系统。

ARTIC v3引物池包含在COVIDSeq检测试剂盒（96个样本）中。它包含针对严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型原始毒株设计的98个扩增子和11个人类基因的引物。可选 ARTIC v4第一池 包括99个扩增子，没有针对德尔塔变异设计的人类对照。它提高了刺突蛋白基因座的基因组覆盖率，并提高了严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型变异检测的分析灵敏度。

/ 结果

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优化的试剂盒提供了更高的簇密度和读取长度，与早期版本相比提高了测序质量分数。

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COVIDSeq测试（RUO版本）

这种高通量NGS检测使实验室能够检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型突变，以识别和跟踪新变异的出现和流行情况。

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