通过农业联盟,成员们私下或公开合作,共同推进对农业基因组学的集体理解。足球外围投注APP-买球网站推荐促进了育种者和研究人员之间的许多合作,从而能够为农业相关物种开发定制产品。我们的微阵列技术是许多农业联盟产品的基础,包括为下面列出的物种开发的产品。
苹果基因分型小组由RosBREED开发,RosBREED是一个多机构、跨国项目,致力于利用有针对性的基因组学应用和工具来改善蔷薇科作物,以提高育种计划的效率。SNP是为在全球育种种质中使用而开发的,包括基于Sanger的eSNP和从27个重要创始种质的配对末端测序中鉴定出的SNP。该社区为苹果基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为定制苹果基因分型阵列的80000多个附加标记的基础内容。
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大麦50K联盟阵列具有约44000个SNP,这些SNP来自170个精心挑选的大麦种质的外显子组捕获数据。它涵盖了广泛的欧洲种质资源中存在的遗传变异。Barley 50K联盟阵列由James Hutton研究所设计,指的是最近发布的大麦假分子基因组组装。
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SNP已从80个甘蓝型油菜品系、4个甘蓝型甘蓝品系和4个菜青虫品系中提取或验证,因此被设计为在任何芸薹A或C基因组物种中都能很好地发挥作用。可以预期,甘蓝型油菜种质中SNP的多态性最高。国际芸薹属SNP联盟提供了多达16个独立的SNP来源,并在SNP选择中进行了考虑。这些数据集来自80多个芸薹属品系,包括转录组和基因组下一代序列数据。多个实验室验证了13000多个SNP,以确保独立SNP发现管道的有效性。社区为该产品开发了一个集群文件,TraitGenetics、GmbH和加拿大农业和农业食品公司对集群文件开发做出了主要贡献。此阵列上可以添加多达30000个额外标记的附加内容,以实现真正定制的芸薹属基因分型阵列。
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樱桃基因分型小组由RosBREED开发,RosBREED是一个多机构、跨国项目,致力于利用有针对性的基因组学应用和工具来提高育种计划的效率,从而改善蔷薇科作物。SNP是为在全球育种种质中使用而开发的,包括基于Sanger的eSNP和从16个甜樱桃重要创始种质和8个酸樱桃创始种质的配对末端测序中鉴定出的SNP。该社区为RosBREED Cherry基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为定制Cherry基因分型阵列的80000多个附加标记的基础内容。
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国际棉花SNP联盟基因分型小组是一个70000个标记阵列,其中包含来自陆地棉、巴巴多斯棉、毛棉和鼬棉的SNP。少数尝试的珠子类型将专门用于G.longicalyx和G.armourianum。该面板具有多种用途,包括遗传多样性分析、遗传作图、QTL分析、候选基因发现、标记辅助选择、基因组选择和基因组序列组装。在包括澳大利亚、美国、印度和中国陆地棉品种在内的种质系上发现并验证了种内SNP。该面板适合作为定制棉花基因分型阵列的20000多个附加标记的基础内容。
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国际豇豆SNP联盟基因分型小组是一种工具,旨在通过促进具有理想性状的新豇豆品种的开发来满足不断增长的世界人口的需求,如更高的产量和质量、抗病性、抗虫性和耐旱性。主要重点是强调与撒哈拉以南非洲和美国生产地区相关的育种种质的多样性。还包括针对中国育种种质的大量报道。该社区计划为豇豆基因分型阵列提供一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为定制豇豆基因分型阵列的30000多个附加标记的基础内容。
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Wheat Barley 40K v1.0 BeadChip采用经过验证的Infinium Assay技术,提供业内最高的通话率和灵活的内容设计。凭借全球小麦和大麦品种的插补能力,这款BeadChip支持多种应用,包括:
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樱桃基因分型小组由RosBreed开发,RosBreed是一个多州、多机构、跨国项目,致力于利用有针对性的基因组学应用和工具来提高育种计划的效率,从而改善蔷薇科作物。SNP是为在全球育种种质中使用而开发的,包括基于Sanger的eSNP和从23个重要创始种质的配对末端测序中鉴定出的SNP。该社区为RosBREED Peach基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该芯片适合作为定制Peach基因分型阵列的80000多个附加SNP含量的基础含量。
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Pepper Consortium Array旨在实现多种辣椒物种的经济高效基因分型。该阵列由TraitGenetics GmbH、加州大学戴维斯分校(UC Davis)和足球外围投注APP-买球网站推荐组成的联盟开发,包含从22个辣椒品系(包括甜块状辣椒和辣椒)的高质量测序数据中精心挑选的内容。该阵列包含16405个SNP。UCD/TraitGenetics打算很快向社区提供一个集群文件。
该面板适合作为定制Pepper基因分型阵列的50000多个附加标记的基础内容。
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马铃薯基因分型面板是由茄科协调农业项目(SolCAP)开发的。使用来自Kennebec、Bintje和Shepody ESTs的基于Sanger的SNP以及从足球外围投注APP-买球网站推荐转录组测序中鉴定的SNP完成了SNP的发现。该社区为马铃薯种质的快速自动化分析提供了一个集群文件。SolCAP Potato Consortium Beadchip适合作为定制马铃薯基因分型阵列的70000多种附加成分的基础成分。
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高粱联盟阵列具有约50000个SNP,覆盖了97%以上的S.bicolor基因,平均每13.5kb有一个SNP。它包括来自S.bicolor参考的约34000个基因、约8500个用于育种的SNP、约22700个SNP外显子基因、剩余基因上游/下游5kb内的约4200个SNP,以及Brenton等人鉴定的其他靶标。高粱联盟阵列使研究人员能够以低成本检测全球高粱种群中的常见/罕见变异。
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BARCSoy6K面板是由贝尔茨维尔农业研究中心(BARC)大豆基因组学和改良实验室为大豆社区的更大利益而开发的。它可用于定量性状位点(QTL)分析、筛选大豆种质资源,并为有兴趣开发附加组件含量的群体提供具有均匀基因组覆盖率的碱基含量,以创建更高密度的定制大豆面板。该社区为大豆基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为84000多个附加探针的基础成分,用于定制大豆基因分型阵列。
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SolCAP番茄基因分型小组由茄科协调农业项目(SolCAP)设计,专注于将最新的基因组进展转化为茄科育种计划。SNP包括来自TA496 EST和Heinz 1706(加工番茄)品系基因组测序的基于Sanger的eSNP,以及通过足球外围投注APP-买球网站推荐转录组测序鉴定的NC84173(新鲜市场)、FL7600(新鲜市场”)、OH08-6405(新鲜市场“)、OH9242(加工番茄”)、PI114490(樱桃)和PI128216(鼠尾草)品系的SNP。SolCAP生成了四个栽培品种的序列数据,一个番茄变种cerasiformae登录,一个紫锥孢登录。该社区为SolCAP番茄SNP阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。它适合作为定制番茄基因分型阵列的80000多种附加成分的基础成分。
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葡萄基因分型小组由GrapeReSeq联盟设计,该联盟是由法国、西班牙、意大利和德国成员组成的跨国植物新技术联盟的一个研究项目。SNP包括使用Infinium技术验证的Vitis9kSNP集合中的公开SNP数据,以及合作产生的新内容。这种SNP基因分型工具可用于绘制和评估葡萄科基因库中的遗传多样性,以支持遗传资源和育种计划的开发,从而减少葡萄栽培中化学处理的使用。该社区为GrapeReSeq联盟基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为定制葡萄基因分型阵列的70000多个附加内容的基础内容。
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由于其经济重要性,牛是第一个被绘制基因组图谱的家畜。足球外围投注APP-买球网站推荐与多个联盟合作开发了Infinium BeadChips,其中包括代表三个肉牛和奶牛种群遗传多样性的新SNP位点,包括牛(Btt)、牛(Bti)和几个Bti x Btt品种,以及这些群体中的温带和热带适应品种。这些BeadChips使研究人员能够研究任何品种牛的基因组遗传变异。
Equine80K具有约80000个SNP,涵盖:
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山羊基因分型小组由国际山羊基因组联盟开发。在SNP发现中考虑了该联盟生成的几个数据集,包括山羊基因组支架的从头测序、来自下一代测序的SNP发现测序数据以及来自表达(EST)序列的测序数据。山羊基因分型小组的SNP使用表达序列和绵羊基因组的数据进行注释。对阿尔卑斯山、安哥拉、波尔、克里奥尔、金兰、卡让、萨南、萨凡纳和斯科佩洛斯品种的候选山羊SNP进行了验证。该社区为山羊基因分型阵列提供了一个集群文件,适用于所有项目规模的快速自动化分析。该面板适合作为定制山羊基因分型阵列的30000多个附加标记的基础内容。
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在养羊业中,最重要的动物是“繁殖公畜的公畜”,即生产整个行业使用的公畜的动物。通过对数千只公犬进行基因分型,研究人员可以评估大量具有经济重要特征的变异。为了开发绵羊珠芯片,足球外围投注APP-买球网站推荐与国际绵羊基因组学联盟(ISGC)合作,该联盟由来自AgResearch、贝勒大学、加州大学旧金山分校和澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)的顶尖研究人员组成。为了开发低密度绵羊阵列,足球外围投注APP-买球网站推荐与新西兰的AgResearch合作。
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猪的平均产仔数在8到14头之间,是最多产的家畜之一。在开发猪珠芯片时,足球外围投注APP-买球网站推荐与国际猪SNP芯片联盟合作,该联盟由瓦赫宁根大学、丹麦农业科学研究所、USDA-ARS、USMARC、罗斯林研究所、伊利诺伊大学、爱荷华州立大学、INRA、密苏里大学和剑桥大学的研究人员组成。