足球外围投注APP-买球网站推荐癌症热点面板的AmpliSeq v2

有针对性的研究小组调查了50个已知与癌症相关基因的热点区域。

5小时(仅用于库准备;不包括库量化、归一化或池化时间)

检测时间

<1.5小时

动手时间

1–100纳克(建议每个游泳池10纳克)

输入数量

详见规格表

概述

足球外围投注APP-买球网站推荐癌症热点小组v2的AmpliSeq是一种靶向重测序分析,用于研究与癌症有已知关联的50个基因的热点区域的体细胞突变,如癌症体细胞突变目录(COSMIC)所述1数据库。 

主要特点

  • 相关基因含量-靶向50个癌基因和肿瘤抑制基因的2800个COSMIC突变

  • 快速、简化的工作流程-仅需1 ng高质量或10 ng福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品,即可在一天内准备测序就绪的文库

  • 准确的数据-使用本地或基于云的分析检测低至5%变异等位基因频率的体细胞突变

癌症热点小组是集成工作流程的一部分,包括基于足球外围投注APP-买球网站推荐聚合酶链式反应(PCR)的文库制备的AmpliSeq、足球外围投注APP-买球网站推荐合成测序(SBS)下一代测序(NGS)技术和自动化分析。

该面板能够在多种癌症类型中进行高度敏感的变异检测,包括肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤和前列腺癌。即用型面板为您节省了识别目标、设计引物和优化面板的时间和精力。


规格


所需产品

足球外围投注APP-买球网站推荐癌症热点面板的AmpliSeq工作流程需要癌症热点面板、Library PLUS套件和索引适配器。

/ 结果

应用

工作流程示例


项目建议

仪器仪表 推荐样本数量 读取长度
Seq 100系统

每次运行16个样本(假设最小覆盖范围为500×)

2×150 bp

MiniSeq系统

每次运行的样本数:中等输出:32,高输出:96(假设最小覆盖率为500×)

2×150 bp

MiSeq系统

每次运行的样本数(按试剂盒版本):v2 nano:4,v2 micro:16,v2:60,v3:96(假设最小覆盖率为500倍)

2×150 bp


相关应用和方法

比较

足球外围投注APP-买球网站推荐癌症热点面板的AmpliSeq v2 AmpliSeq用于足球外围投注APP-买球网站推荐聚焦面板 AmpliSeq用于足球外围投注APP-买球网站推荐综合面板v3 TruSight肿瘤15
检测时间 5小时(仅用于库准备;不包括库量化、归一化或池化时间) 5-6小时(仅用于库准备;不包括库量化、归一化或池化时间) 5-6小时(仅用于库准备;不包括库量化、归一化或池化时间) 7小时
癌症类型 泛癌,实体瘤 实体瘤 实体瘤 泛癌,实体瘤
内容规范 50个已知与癌症相关基因的热点区域 52种癌基因的DNA和RNA靶点 161种癌基因的DNA和RNA靶点 扩增与实体瘤相关的15个基因的250个扩增子
说明 对50个癌症相关基因热点区域的体细胞分析研究。 52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 实体瘤相关基因热点和全长靶点的体细胞分析研究。 使用20ng DNA对实体瘤中15个常见突变基因进行NGS检测。 
动手时间 <1.5小时 <1.5小时 <1.5小时 3.5小时
输入数量 1–100纳克(建议每个游泳池10纳克) 1–100纳克(建议每个游泳池10纳克) 1–100纳克(建议每个游泳池10纳克) 20 ng FFPE DNA
仪器仪表 MiSeq系统, Seq 100系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统 MiSeq系统, Seq 100系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统 NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, NextSeq 550Dx处于研究模式 MiSeq系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统
作用机制 多重PCR 多重PCR 多重PCR
方法 靶向DNA测序, Amplicon测序 靶向DNA测序, Amplicon测序, 靶向RNA测序 靶向DNA测序, Amplicon测序, 靶向RNA测序 靶向DNA测序, Amplicon测序
多路复用 96种双指数组合 96种双指数组合 96种双指数组合 1-24倍
核酸类型 DNA DNA、RNA DNA、RNA DNA
扩增子数量 总计207。1个游泳池。 总计553。2个游泳池。(DNA池:269个扩增子。RNA池:284个扩增子) 4648共4个池(DNA池1:1891个扩增子。DNA池2:1890个扩增子,RNA池1:447个扩增子;RNA池2:420个扩增子)
专业样品类型 FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织
物种分类 人类 人类 人类 人类
技术 测序 测序 测序 测序
变量类 单核苷酸多态性(SNPs)、体细胞变异、插入缺失(indels) 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、体细胞变异、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs) 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、体细胞变异、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs) 体细胞变异,插入-缺失(indels)

面板(1)

足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™癌症热点面板v2

20019161

用于评估50个癌症相关基因热点区域体细胞突变的靶向小组。试剂盒包含24个反应。Library PLUS和索引适配器单独出售。

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图书馆准备(3)

足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™库PLUS(24个反应)

20019101

包括用于制备24个文库的试剂。单独购买用于足球外围投注APP-买球网站推荐面板和索引适配器的AmpliSeq。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™库PLUS(96个反应)

20019102

包括用于制备96个文库的试剂。单独购买用于足球外围投注APP-买球网站推荐面板和索引适配器的AmpliSeq。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™库PLUS(384个反应)

20019103

包括用于制备384个文库的试剂。单独购买用于足球外围投注APP-买球网站推荐面板和索引适配器的AmpliSeq。

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索引适配器()

足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™UD指数(24个指数,24个样本)

20019104

包括24个索引,足以标记24个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®AmpliSeq™CD索引集A

20019105

包括96个索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®AmpliSeq™CD索引集B

20019106

包括96个索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®AmpliSeq™CD索引集C

20019107

包括96个索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®AmpliSeq™CD索引集D

20019167

包括96个8 bp的索引,足以标记96个样本。分别购买库制备试剂和探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®的AmpliSeq™CD索引集A-D(384个索引,384个样本)

20031676

包括四组用于足球外围投注APP-买球网站推荐、A组、B组、C组和D组的AmpliSeq CD索引。每组包含96个8 bp的索引,足以标记96个样本。分别购买库准备和探头面板。

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配件产品(3)

AmpliSeq™ 照明® 样本ID面板

20019162

包括8个单核苷酸多态性(SNP)靶向引物对和一个性别歧视引物对,当与足球外围投注APP-买球网站推荐的AmpliSeq Library PLUS配对时,足以进行96次反应。实现快速准确的样本识别。分别购买库准备、探测面板和索引适配器。

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AmpliSeq™用于足球外围投注APP-买球网站推荐®直接FFPE DNA

20023378

包括24个反应,使用AmpliSeq for 足球外围投注APP-买球网站推荐方案从未染色、载玻片的FFPE组织中制备DNA,用于构建文库,无需脱蜡或DNA纯化。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®AmpliSeq™库均衡器

20019171

在为足球外围投注APP-买球网站推荐文库制备AmpliSeq进行测序时,包括用于文库标准化的珠子和试剂。

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先进的化学、光学和信息学相结合,可提供卓越的速度和数据质量、出色的吞吐量和可扩展性。

MiSeq试剂盒v3

优化的试剂盒提供了更高的簇密度和读取长度,与早期版本相比提高了测序质量分数。

TruSight肿瘤学500

通过一个大型泛癌面板启用CGP,该面板涵盖所有主要变体类别以及FFPE组织的基因签名(TMB、MSI和HRD)。

照亮DNA制备

一个快速、集成的工作流程,用于准备在各种测序应用中使用的库。

工具书类

  1. Kingsmore S.癌症体细胞突变目录-主页。http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic.2017年10月25日访问。

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