长读测序是一种DNA测序技术,它能够对比传统短读测序方法更长的DNA片段进行测序。虽然短读可以捕获大部分遗传变异,但长读测序可以检测到短读可能难以检测到的复杂结构变异。这些包括大的倒置、缺失或易位,其中一些与遗传疾病等领域有关。
长读技术可以通过对数千个碱基进行测序来帮助解决基因组中具有挑战性的区域:
足球外围投注APP-买球网站推荐 Complete Long Read技术使用标记来规范长片段大小。长片段被“标记”以捕获单分子、长读信息并放大。标记的片段被标记到标准库中进行测序。来自标准短读基因组序列的标记和未标记数据被组合在一起,以生成高度准确的长读。
将长读数据与互补的短读信息相结合可能是有利的。许多长时间读取的解决方案具有费力的工作流程和高度可变的结果。1-4短读取(通常为50-600bp)以低成本提供高数据质量和序列深度。通过先进的数据分析,短读测序可以以极高的准确性生成全基因组变异调用。此外,一小部分基因区域可以从长读信息中受益,以提高最难绘制的基因的分辨率。
转座酶连锁长读测序(TELL-Seq)技术使用连锁读来生成非连续的长距离数据,以提供信息 从头开始 装配或超长距离(>1Mb)定相。这种替代的测序数据类型可用于补充新的或复杂的基因组的标准短读。
TELL-Seq技术产生超长相位块,为进行基因组相位研究提供了一种可访问的解决方案。
TELL-Seq在微生物WGS方面表现出卓越的性能,即使在具有挑战性的样品或GC含量高的地区也是如此。
在这个录制的网络研讨会中,了解研究人员如何使用转座酶-酶联长读测序(TELL-Seq)对九种昆虫的基因组进行测序和组装。