冠状病毒软件
足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包
| 新型病原体检测 |  |
WEAR宏基因组学应用程序 | ||
|---|---|---|---|---|
| 检测和监视 |  |
DRAGEN RNA病原体检测应用程序 |  |
DRAGEN新冠肺炎谱系应用程序 |
| 共享与协作 |  |
SRA导入应用程序 |  |
GISAID提交应用程序 |
| 足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包可在BaseSpace序列中心获得。 | ||||
关于足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包
用于检测和监测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的冠状病毒软件分析解决方案套件在 BaseSpace序列中心该工具包由基于以下内容构建的几个工具组成足球外围投注APP-买球网站推荐 DRAGEN二次分析，以及BaseSpace Sequence Hub上的数据提交应用程序，使研究人员能够无缝地将他们的发现提交到公共数据库。
DRAGEN冠状病毒软件工具
足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包利用DRAGEN的速度和准确性来加快传染病监测和疫情应对。该工具包包括用于识别新型传染病病原体的DRAGEN宏基因组学管道、用于检测病毒病原体的DRAGAN RNA病原体管道，以及用于检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型突变的DRAGAN-Lineage应用程序，用于流行病学。DRAGEN冠状病毒工具可以在BaseSpace Sequence Hub上访问。有关DRAGEN平台冠状病毒检测和监测的更多信息，请参阅 这篇软件博客文章.
DRAGEN RNA病原体检测管道，用于病毒病原体的检测和监测
DRAGEN RNA管道的更新版本现在可用于加速病毒病原体的检测。该管道有助于在任何DRAGEN RNA-Seq管道运行中检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型，无论应用如何。该管道包括：
- 全面检测，利用覆盖率和基于k-mer的方法检测病毒病原体
- 与足球外围投注APP-买球网站推荐呼吸道病毒靶点富集工作流程的兼容性
- 使用人类基因组参考（hg38）与选定病毒参考序列的组合进行人类和病毒参考
- 集成FASTA生成，可上传到公共数据库，如GISAID
DRAGEN新冠肺炎谱系应用程序
该应用程序将读数与严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型参考基因组对齐，并报告目标区域的覆盖范围。它执行以下操作：
- 基于K-mer的检测
- 映射/对齐，变量调用
- 共识序列生成
- 使用穿山甲和NextClade进行谱系/支系分析
用于临床应用的冠状病毒软件
对于希望生成SARS-CoV-2检测的临床报告以诊断有症状患者的新冠肺炎的用户，DRAGEN COVIDSeq测试管道与足球外围投注APP-买球网站推荐新冠肺炎序列测试。
对于希望生成霰弹枪宏基因组学报告的用户，IDbyDNA开发的Explify平台提供了简单、强大的生物信息学软件，将足球外围投注APP-买球网站推荐测序仪生成的数据转化为可操作的见解。这个经过验证的自动化平台支持检测35种呼吸道病毒，包括严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型的基因组特征。 联系我们 了解更多。
主机响应研究的相关引擎
足球外围投注APP-买球网站推荐为新冠肺炎研究社区提供了一个合作环境，以更好地了解调节宿主反应的关键因素，并帮助确定潜在治疗的生物标志物。
Correlation Engine如何推进您的研究：
- 将其置于上下文中： Correlation Engine挖掘了数千项基因组研究，使研究人员能够将他们的数据与世界基因组知识库整合，以生成数据驱动的答案。
- 加速研究： 通过利用Correlation Engine即时查询数千项研究来缩短发现时间，并通过实时进行数据驱动查询来帮助验证假设。
- 保持最新状态： 足球外围投注APP-买球网站推荐有一个专门的团队，致力于用策划的新冠肺炎数据更新Correlation Engine，并欢迎研究社区成员贡献他们的发现，以帮助推进新冠肺炎研究。
- 集成： Correlation Engine是我们全套转录组学产品的集成扩展，可帮助研究人员无缝地从样本导航到答案。
- 协作：相关引擎使研究人员能够贡献他们的数据并与研究社区共享，以促进我们对新冠肺炎宿主反应的理解。
科学家可以使用Clarity LIMS处理样本。测序完成后，研究人员可以使用该工具包自动将数据流式传输到BaseSpace Sequence Hub。
为端到端解决方案供电
严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型检测
足球外围投注APP-买球网站推荐正在使用具有全面、集成工作流程的NGS使检测和识别严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型变得更加简单。
冠状病毒软件工具包与足球外围投注APP-买球网站推荐呼吸道病毒靶点富集工作流程兼容，使研究人员能够安全地将数据直接从我们的全套测序仪中传输到BaseSpace Sequence Hub，以便使用DRAGEN RNA病原体检测应用程序进行快速、全面的分析。一旦分析完成，研究人员可以直接从BaseSpace序列中心向全球共享所有流感数据倡议（GISAID）提交数据。
对于希望提高实验室效率的科学家来说，Clarity LIMS可用于跟踪和监测新冠肺炎样本，提供全面的端到端解决方案。
Clarity LIMS呼吸道病毒专家组工作流程
全面的工作流管理和样本跟踪
Clarity LIMS提供高效的样品跟踪和工作流程自动化。以下与冠状病毒相关的工作流程可用：
- 基于CDC建议的CDC新冠肺炎RT-PCR工作流程
- 呼吸道病毒专家组工作流程
这些工作流程有助于确保样本可用于分析，使实验室能够快速处理冠状病毒样本，从样本访问和库准备到对测序运行进行质量控制。
了解更多关于Clarity LIMS的信息
轻松安全地共享、协作和提交到公共数据库
BaseSpace Sequence Hub旨在促进研究小组之间安全、审计控制的协作。数据管理和共享功能（如工作组）允许您与合作者共享项目并安全运行，而无需下载文件。
足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包具有几个功能BaseSpace序列中心应用程序 为了合作。这个 GISAID提交应用程序 接受VCF或FASTA文件的集合，以及相同样本的元数据CSV。该应用程序在将数据提交给GISAID进行进一步的质量保证和处理之前执行数据验证。
下载BaseSpace安全和隐私信息如何访问足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包
BaseSpace Sequence Hub上提供了完整的足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包。更新后的DRAGEN新冠肺炎工具也可在DRAGEN服务器上使用，并通过DRAGEN API向开发人员提供。要请求访问DRAGEN API，请填写下表。
BaseSpace序列中心的足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包
研究人员今天就可以开始在BaseSpace Sequence Hub上免费使用足球外围投注APP-买球网站推荐严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型NGS数据工具包。研究人员可以将数据直接从他们的仪器流式传输到BaseSpace的安全云环境中，以便按按钮使用整个工具包。
了解有关BaseSpace序列中心的更多信息特色产品
BaseSpace序列中心和iCredits
BaseSpace Sequence Hub允许您使用一组精心策划的分析应用程序轻松管理和分析数据。iCredits是用于购买足球外围投注APP-买球网站推荐基因组数据存储和分析选项的货币。
DRAGEN生物信息技术平台
足球外围投注APP-买球网站推荐 DRAGEN生物信息技术平台提供准确、超快速的测序数据二次分析。
NextSeq 2000系统和试剂
NextSeq 2000系统支持新兴和中等通量测序应用，以及外显子组测序、靶富集、单细胞分析、转录组测序等多种方法。
要请求访问DRAGEN API，请填写下表。
新冠肺炎宿主风险与应对
了解宿主遗传差异和个体对严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型病毒的反应，可以加深对疾病易感性和严重程度的理解。阅读更多关于宿主风险和免疫反应研究的方法。
了解宿主遗传学和免疫反应分析
其他冠状病毒软件工具
目标浓缩管道
DRAGEN浓缩管道也可用于检测和识别严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型。该管道可在BaseSpace Sequence Hub上使用，每件样品的成本较低，并且可以在DRAGEN服务器上访问。
了解更多关于DRAGEN浓缩的信息