癌症表观遗传学
为什么表观遗传学对癌症研究很重要？
癌症是一种基因组疾病，但基因突变只是其中一个因素。非遗传变化也会影响表型。了解表观遗传学景观对于建模癌症的发生、发展和治疗反应越来越重要。表观基因组学着眼于细胞如何通过DNA甲基化等过程控制基因活性。
表观基因组技术可以识别与癌症基因调节或耐药性相关的细胞生物标志物：
- 染色质可及性
- 染色质相互作用
- DNA修饰
- DNA-蛋白质相互作用
癌症表观遗传学变化的研究方法
ATAC序列
癌症研究人员可以使用ATAC-Seq来研究整个基因组的表观遗传学特征，而无需事先了解调控元件。ATAC-Seq将基因组DNA暴露于Tn5，Tn5是一种高活性的转座酶，优先插入开放的染色质位点并添加测序引物。后续的NGS分析，包括基因组或转录组分析，提供了对整个基因组染色质可及性的见解。
虽然染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）、甲醛辅助调节元件分离测序（FAIRE-Seq）或DNase I超敏位点测序（DNase-Seq）等几种传统方法可用于研究染色质与DNA相互作用位点的区域，但ATAC-Seq可以照亮开放染色质的区域。
ATAC-Seq的主要优势
- 研究人员可以通过使用Tn5转座酶来避免染色质的敏感酶消化或抗体的严格验证
- 可以询问珍贵的癌症样本，输入要求低至500-50000个细胞
- 研究人员可以快速获得结果，简化的工作流程可以在不到3小时内完成
- ATAC-Seq可以与RNA-Seq配对，直接确定开放染色质区域是否表达
甲基化阵列
甲基化阵列使研究人员能够以单核苷酸分辨率定量询问癌症细胞表观基因组中的甲基化位点。基于阵列的解决方案提供了全面的全基因组覆盖，包括但不限于CpG岛、CHH位点、增强子、开放染色质和转录因子结合位点。作为一种高通量研究方法，与甲基化测序替代方案相比，每个样本的成本最低。
甲基化阵列方案具有用户友好、简化的工作流程，检测再现性>98%，支持FFPE样本，提高了甲基化阵列对生物库组织的适用性。
甲基化阵列的主要优势
- 样本到数据的简单性
- 与困难样品类型（如FFPE样品）的兼容性
- 样本间组织特异性差异的分类
- 低成本与其他方法
ChIP序列
染色质免疫沉淀（ChIP）测序（ChIP-Seq）是鉴定转录因子和其他蛋白质全基因组DNA结合位点的有力方法。这种方法可以揭示基因调控事件和生物学途径的见解，这些事件和途径在某些癌症的发展和进展中起着重要作用。足球外围投注APP-买球网站推荐提供高效的工作流程解决方案，使您能够使用ChIP-Seq进行全基因组基因调控调查。
ChIP-Seq的主要优势
- 捕获任何生物体整个基因组中转录因子或组蛋白修饰的DNA靶标
- 定义转录因子结合位点
- 结合RNA测序和甲基化分析揭示基因调控网络
- 提供与各种输入DNA样本的兼容性
癌症研究的表观遗传学分析产品
无限甲基EPIC微珠芯片试剂盒
- 以专家精选内容为特色的微阵列
- 单核苷酸分辨率下每个样本覆盖>850000个甲基化位点
- FFPE兼容性
iScan阵列扫描仪
- 高样本吞吐量
- 多种应用的灵活性
- 高数据质量
- 自动化兼容性
TruSeq ChIP文库制备工具包
- 从ChIP衍生的DNA生成染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）文库
- 低DNA输入要求
- 具有24个独特索引的多重测序
癌症主要表观遗传学分析资源
表观遗传学在癌症研究中的重要性
这张信息图是一个视觉指南，可以了解为什么表观基因组学对癌症的理解有很大影响。
利用甲基化微阵列了解癌症生物学
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用多组学推进癌症研究
学习如何通过多组学将复杂表型的原因和后果联系起来，以实现以前不可能的发现。