植物和动物测序
农业和环境中的基因组测序
世界各地的研究人员正在使用植物和动物测序来研究不同物种的基因组。这些基因图谱为发现提供了丰富的基础，帮助我们了解生命和进化，并找到保护濒危物种的新方法。
在农业中利用下一代测序（NGS）也将有助于开发更具生产力和可持续性的实践，这样我们就可以共同应对不断变化的环境的挑战和养活不断增长的人口的需求。
农业中的基因组测序方法
| 方法 | 说明 | 使用 |
|---|---|---|
| De Novo测序 | De Novo 植物或动物测序是了解生物体特征和与环境相互作用的遗传基础的第一步。 | 分配图谱位置并堆叠品种信息，以便后续重新测序，以发现单核苷酸多态性（SNP）和其他遗传变异。 |
| 全基因组重测序 | 当物种的参考基因组可用时，分析整个基因组的综合方法。 | 识别基因、SNP和结构变异，同时确定基因型。 |
| 转录组测序 | RNA测序为发育过程中以及疾病和应激条件下发生的基因表达水平变化提供了新的见解。 | 阐明基因和蛋白质的功能和相互作用，鉴定RNA转录物的组织特异性列表，并发现新的SNP。 |
| 表观遗传学 | 对环境变化（如粮食供应或干旱条件）的适应性反应会引发植物和动物的表型变化，影响其生存能力和生殖健康。 | 通过使用测序来识别DNA甲基化、染色质结构和小RNA表达的变化，您可以更好地了解表观遗传因素如何在感兴趣的物种中控制这些和其他特征。 |
| 目标序列捕获测序技术 | 这种方法对许多样本上的预定遗传变异区域进行测序。 | 识别常见和罕见的变异，如SNP和拷贝数变异（CNVs），以帮助为育种决策提供信息或描述疾病易感性。 |
| 通过测序进行基因分型 | 一种低成本的基因筛查方法，用于发现新的植物和动物SNP并进行基因分型研究，通常在许多样本中同时进行。 | 应用包括遗传作图、筛选回交系、纯度测试、构建单倍型图谱，以及为植物基因组研究进行关联和基因组评估。 |
| 环境DNA测序 | 一种有效的生物监测工具，可以表征水生、土壤和其他样本中的细菌和真核生物。 | 应用包括港口监测、生物多样性调查、压载水测试、土壤测试等。 |
| 基因组编辑 | CRISPR（簇状规则间隔短回文重复序列）基因组编辑在农业、食品科学、环境科学和广泛的其他应用中具有巨大的潜力。 | 确认基因敲除，分析靶向和靶外效应，并评估基因编辑的功能影响。 |
基因组学与养活饥饿的世界
数千年来，农业一直在维持和改善人类生活，但不断变化的环境和不断扩大的人口正在增加对更具生产力和更可持续的农业的需求。听多样性阵列技术的Andrzej Kilian博士描述基于NGS的基因分型如何帮助开发更可持续的农业实践。
听我说
植物基因组测序加速作物研究
本次网络研讨会讨论了高质量、经济实惠的影响 De Novo 作物研究中的基因组组装。特拉维夫大学的Assaf Distelfeld讨论了最近产生的小麦祖细胞基因组组装，以及这种新资源如何帮助改善小麦育种。
查看网络研讨会特色产品
有兴趣接收时事通讯、案例研究和农业基因组学信息吗？输入您的电子邮件地址。
动植物基因组测序资源
农业NGS简介
足球外围投注APP-买球网站推荐下一代农业研究测序技术指南。
恢复哥伦比亚河流域的鱼类种群
一种新的测序方法降低了成本，并能够分析数万条鱼。
通过测序研究进行基因分型
本文作者使用测序来研究不同倍性水平的作物。
测序使山羊群的选择性育种成为可能
新西兰的研究人员使用测序进行基因分型，以克服与基因组选择相关的成本和资源障碍。