RNA测序

RNA测序导论

RNA测序(RNA-Seq)正在彻底改变转录组的研究。这是一种高度敏感和准确的工具,用于测量转录组中的表达,它为科学家提供了对疾病状态、治疗反应、不同环境条件下以及各种其他研究设计中以前未被发现的变化的可见性。

RNA-Seq使研究人员能够在一次检测中检测已知和新的特征,从而能够在不受先验知识限制的情况下鉴定转录亚型、基因融合、单核苷酸变体和其他特征。1,2

日落时分,湖边的孩子们——RNA-Seq正在改变我们周围的世界
推动RNA-Seq的进展

RNA测序可以对研究和创新产生深远的影响,改变我们对周围世界的理解。

RNA测序的好处

带有下一代测序(NGS)的RNA-Seq越来越成为科学家研究转录组的首选方法。

  • 覆盖极宽的动态范围
  • 提供灵敏、准确的基因表达测量
  • 捕捉已知和新颖的特征;不需要预先设计的探测器
  • 生成定性和定量数据
  • 揭示完整的转录组,而不仅仅是几个选定的转录组
  • 即使没有参考序列,也可以应用于任何物种
RNA测序增强转录组学

了解RNA-Seq如何在各个领域推进转录组研究,以及基因调控研究如何提供补充信息。

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RNA测序出版物综述

RNA-Seq是迄今为止被引用最多的NGS方法。本合集包含协议图、优缺点,以及以足球外围投注APP-买球网站推荐技术为特色的各种RNA-Seq方法的相关同行评审出版物。

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RNA-Seq常见问题

是的,RNA-Seq是一种公认的量化基因表达的方法。要了解RNA-Seq与微阵列和定量PCR(qPCR)的比较,请查看以下页面:

转录组学广义上是指研究与其表达水平、功能、结构和调控相关的RNA。RNA-Seq更具特异性,是指研究RNA序列和数量的技术。

RNA测序深度是通过测序获得的碱基总数与基因组大小的比率,或者是在基因组中测量每个碱基的平均次数。

Bulk RNA-Seq是一种分析细胞或组织中混合RNA的方法。

RNA测序的搁浅性使研究人员能够确定转录物来自哪条DNA链(正义或反义)。与常规的RNA测序方法相比,单链RNA测序可以发现新的转录物,将转录物与重叠的基因区分开来,找到反义序列,并注释基因。

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在mRNA文库制备方法中,通过寡核苷酸珠从总RNA中选择mRNA,因此文库仅从样品的聚腺苷酸化转录物中制备。在总RNA工作流程中,rRNA和选择的其他丰富转录物从样本中被耗尽,剩余的RNA被制备成测序文库,包括聚腺苷酸化和非聚腺苷酸化的RNA。在富集工作流程中,文库是从所有RNA样本中制备的。随后使用寡核苷酸探针板对这些文库进行富集。面板可以靶向全编码外显子组、与特定疾病相关的转录本、病原体的RNA或定制靶标。有关这些工作流的更多信息,请访问以下页面:

提取的RNA必须经过纯化,不含污染物。足球外围投注APP-买球网站推荐建议遵循特定RNA分离试剂盒中提供的指南,并为您的样本类型选择合适的方案。

以下提供了所选方法的RNA输入范围:

RNA-Seq与所有足球外围投注APP-买球网站推荐测序仪兼容。根据库制备试剂盒、应用和数据需求,更高或更低吞吐量的测序仪可能更合适。

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是的,RNA-Seq文库制备方法可以自动化。访问我们的 图书馆准备自动化 页面了解更多信息。

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  1. 王Z,Gerstein M,Snyder M.RNA-Seq:一种革命性的转录组学工具。 Nat Rev Genet。 2009;10:57–63.
  2. Wilhelm BT,Landry JR.RNA-Seq——通过大规模并行RNA测序定量测量表达。 方法。 2009;48:249–57.