照亮DNA制备

一个快速、集成的工作流程,用于准备在各种测序应用中使用的库。

~3-4小时(从DNA提取到标准化文库)

检测时间

1-1.5小时

动手时间

小基因组(如微生物)的1-500ng DNA或大基因组(如人类)的100-500ng DNA。(有关血液和唾液,请参阅参考指南)。

输入数量

详见规格表

Nextera DNA Flex产品现在被称为足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep。(M)名称表示一种珠连接的转座子,产生约350bp的插入大小。我们建议订购足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA/RNA UD指数集A-D(20091654、20091656、20091658、20091660)。足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA/RNA UD指数集A-D的IDT(20027213、2002721420042666、20042667)正在停产;最后一个订单日期是2025年1月30日。

概述

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep,以前称为Nextera DNA Flex,提供了一种快速、稳健和灵活的工作流程,用于从各种DNA输入类型和数量中制备标准化、测序就绪的文库,从而促进了从人类全基因组测序到扩增子、质粒和微生物物种测序的一系列应用。1

  • 提供均匀的基因组覆盖和卓越的数据质量

  • 通过集成DNA提取方案提高文库制备效率

  • 提供快速、用户友好的工作流程,将图书馆的总准备时间缩短至约3.5小时

获得可靠的结果

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep工作流程提供一致的插入尺寸、均匀的覆盖范围和优化的性能,无论DNA输入量或基因组大小如何。基于珠粒的技术最大限度地减少了偏差和出错的机会,从而产生了高度可重复的测序数据。 

访问灵活的吞吐量选项

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA/RNA UD索引集提供多达384个独特的双索引,能够准确分配读数并有效利用流动池。 

足球外围投注APP-买球网站推荐 Advantage产品可用性

该产品也可作为 足球外围投注APP-买球网站推荐 Advantage(TG)产品足球外围投注APP-买球网站推荐 Advantage大规模测序产品具有特定批次的装运和测试、延长保质期和高级变更通知功能,可提高实验室效率。


足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备产品线

寻找快速、优化的测序库制备解决方案,用于广泛的应用。


规格


所需产品

无论用于测序的样本池水平如何,每个足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep试剂盒都需要一个索引试剂盒来完成方案。我们鼓励客户尽可能使用独特的双索引。了解更多信息 选择正确的索引选项 为您的应用。 

索引试剂盒不能与Nextera DNA或Nextera XT索引试剂盒互换。 

Flex Lysis试剂盒是一种单独的产品,补充了足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep的血液DNA提取方面

足球外围投注APP-买球网站推荐纯化珠包含在足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备试剂盒中,不需要单独购买。  

/ 结果

应用

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep支持广泛的DNA输入范围(1-500ng),并在短短3.5小时内为从大型全基因组到扩增子、质粒和微生物物种的测序样本提供高质量的文库。 

工作流程示例


特色应用说明


项目建议

仪器仪表 推荐样本数量 读取长度
NextSeq 550系统

每次运行1个样本(高产量;基于人类基因组的30倍覆盖率)

高达2×150 bp

NovaSeq 6000系统

每次运行2-10个样本(双流式细胞;基于人类基因组的30倍覆盖率)

高达2×125 bp(快速运行)
高达2×150 bp(高产量)


相关应用和方法

文档

比较

照亮DNA制备 TruSeq DNA无PCR TruSeq DNA纳米 Nextera XT DNA文库制备试剂盒
检测时间 ~3-4小时(从DNA提取到标准化文库) 总测定时间为5小时 总测定时间约为6小时 从DNA提取到标准化文库约5.5小时。(图书馆准备时间:~90分钟)。
自动化能力 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人 液体处理机器人
自动化详细信息 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 一个快速、灵活的库准备工作流程,可容纳各种样本类型和DNA输入量,允许访问从人类到微生物全基因组测序等广泛的应用。  一种简单、全面的无PCR全基因组测序研究制剂,能够对基因组中具有挑战性的区域进行测序。 一种低投入的研究方法,可提供高基因组覆盖质量和减少偏见。 在90分钟内为小基因组、PCR扩增子和质粒准备测序文库,DNA输入要求低。
动手时间 1-1.5小时 4小时 ~4小时 15分钟
输入数量 小基因组(如微生物)的1-500ng DNA或大基因组(如人类)的100-500ng DNA。(有关血液和唾液,请参阅参考指南)。 1微克DNA 100ng基因组DNA 1纳克DNA
仪器仪表 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NextSeq 550Dx处于研究模式, NovaSeq X系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus系统 MiSeq系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NovaSeq X系统, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus系统 MiSeq系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, MiSeqDx处于研究模式, MiniSeq系统, NovaSeq X系统, NextSeq 500系统, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus系统 MiSeq系统, Seq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, MiniSeq系统, NextSeq 500系统
作用机制 珠链转座子 机械DNA断裂和接头连接。工作流程不含PCR和凝胶。 机械DNA断裂和接头连接。工作流程使用减少偏差的PCR,无凝胶。 酶促裂解
方法 Amplicon测序, 全基因组测序, 从头测序, 霰弹枪测序 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 霰弹枪测序 通过测序进行基因分型, 全基因组测序, 霰弹枪测序 Amplicon测序, 全基因组测序, 16s rRNA测序, 从头测序, 霰弹枪测序
多路复用 多达384种独特的双重(UD)组合和96种组合双重(CD)组合 最多24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合 最多24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合 最多384个唯一索引的样本可以合并在一起进行测序。
核酸类型 DNA DNA DNA DNA
样本类型详细信息 未经验证可用于FFPE样品
专业样品类型 血液,不兼容FFPE,唾液 不兼容FFPE 不兼容FFPE,低输入样本 不兼容FFPE,低输入样本,单细胞
物种分类 果蝇,任何物种,哺乳动物,小鼠,酵母,斑马鱼,人类,大鼠,植物,病毒,线虫,细菌 其他,哺乳动物,小鼠,人类,大鼠,植物 其他,哺乳动物,小鼠,人类,大鼠,植物 果蝇,任何物种,哺乳动物,小鼠,酵母,斑马鱼,真菌,人类,大鼠,植物,病毒,线虫,细菌
物种详细信息 与任何物种兼容 与大多数大型DNA基因组兼容。 与大多数大型DNA基因组兼容。 与任何物种兼容
目标插入尺寸 约350 bp 350 bp或550 bp 350 bp或550 bp 300 bp–1.5 kb
技术 测序 测序 测序 测序
变量类 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、染色体异常、种系变异、结构变异、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs) 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、染色体异常、种系变异、结构变异、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs) 单核苷酸多态性(SNPs)、基因融合、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、染色体异常、种系变异、结构变异、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNVs) 单核苷酸多态性(SNPs),结构变异

选择工具:

数字

足球外围投注APP-买球网站推荐珠连接转座子化学

(A) 珠链转座子介导gDNA的同时断裂和足球外围投注APP-买球网站推荐测序引物的添加。(B) 缩短周期PCR扩增扩增测序就绪的DNA片段,并添加索引和接头。(C) 洗涤并合并测序就绪的片段。

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep提供最快的足球外围投注APP-买球网站推荐工作流程

从DNA提取到文库标准化和池化的总工作流程时间的比较。足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep以最少的步骤和最快的总工作流程时间生成工作流程。 

提高覆盖均匀性

(A) 足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep在整个基因组中提供了与TruSeq DNA Nano试剂盒相当的均匀覆盖。(B) 显示了GC含量极高或极低的微生物的覆盖率。由于改进了珠标记文库制备化学,足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA prep的覆盖率比Nextera XT更均匀。

资源

了解足球外围投注APP-买球网站推荐技术,该技术旨在为DNA和RNA文库制备提供易于使用、快速和简单的解决方案。

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备试剂盒的介绍性演示。

珠上标记文库制备化学集成了DNA提取、片段化、文库制备和文库归一化。

图书馆准备(2)

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备,(M)标记(24个样本,IPB)

20060060

包括用于制备24个文库的试剂。包括足球外围投注APP-买球网站推荐净化珠。分别购买富集探头面板和索引适配器。

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足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备,(M)标记(96个样本,IPB)

20060059

包括用于制备96个文库的试剂。包括足球外围投注APP-买球网站推荐净化珠。分别购买富集探头面板和索引适配器。

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索引适配器(9)

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)

20091654

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)

20091656

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)

20091658

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)

20091660

足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)包括96个10 bp的指数,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集A,标记(96个指数,96个样本)

20027213

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集B,标记(96个指数,96个样本)

20027214

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集C,标记(96个指数,96个样本)

20042666

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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IDT®用于足球外围投注APP-买球网站推荐®DNA/RNA UD指数集D,标记(96个指数,96个样本)

20042667

包括96个10bp的索引,足以标记96个样本。分别购买文库制备和富集试剂以及探针板。

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Nextera™DNA CD索引(96个索引,96个样本)

20018708

包括20个索引、8个i500和12个i700索引,它们共同提供了96个双索引功能,足以标记96个样本。索引以96孔格式提供。分别购买库准备和探头面板。

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服务项目(1)

足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备-客户现场

20022900

为期一天的足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep文库制备工作流程现场培训。参与者将学习工作流程的所有步骤,包括样本输入和库准备、质量控制、最佳实践和故障排除,此外还将学习足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep工作流程特有的足球外围投注APP-买球网站推荐支持的测序和数据分析工具的培训。

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配件产品()

足球外围投注APP-买球网站推荐净化珠30毫升

20119944

足球外围投注APP-买球网站推荐净化珠30毫升

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足球外围投注APP-买球网站推荐净化珠,100mL

20060057

包括一个100毫升的珠子容器,用于图书馆清理和尺寸选择。分别购买文库制备和富集试剂、探针板和索引。

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足球外围投注APP-买球网站推荐纯化珠,400mL

20060058

包括四个100毫升的珠子容器,用于图书馆清理和尺寸选择。分别购买文库制备和富集试剂、探针板和索引。

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Flex Lysis试剂盒(96个反应)

20018706

包括用于使用足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备和足球外围投注APP-买球网站推荐浓缩DNA制备处理血液样本的试剂。分别购买文库制备、富集、富集探针板和索引适配器试剂。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®免费适配器阻断试剂(12个反应)

20024144

该试剂在文库制备过程中用于降低指数跳跃水平。

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足球外围投注APP-买球网站推荐®免费适配器阻断试剂(48个反应)

20024145

该试剂在文库制备过程中用于降低指数跳跃水平。

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NextSeq PhiX控制套件

FC-110-3002

NextSeq 足球外围投注APP-买球网站推荐测序平台的DNA控制。兼容单端和双端读取,最大可达150 bp。10µl 10 nM PhiX溶液。

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FAQs

是的,足球外围投注APP-买球网站推荐为血液和唾液设计了特定的提取方案。协议可以在 足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA制备参考指南

一般来说,足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep的设计与大多数自动化液体处理系统兼容。 

足球外围投注APP-买球网站推荐的所有自动化合作伙伴都在为至少一个现有的自动化平台开发方法。联系 个人合伙人 了解更多信息。 

GC富集区域的覆盖率可能会受到所用热循环仪的型号、设置和性能的影响。足球外围投注APP-买球网站推荐已经验证了与足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep一起使用的Bio-Rad DNA Engine Tetrad 2、Bio-Rad S1000、Bio-Rade C1000和MJ Research PTC-225 DNA Engine Tetra热循环仪。其他热循环仪的性能可能不同,这可能会影响基因组覆盖率。

是的,足球外围投注APP-买球网站推荐 DNA Prep的最小输入范围(1-500ng)允许使用从干血斑(DBS)卡中提取的DNA。 

/ 结果

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先进的化学、光学和信息学相结合,可提供卓越的速度和数据质量、出色的吞吐量和可扩展性。

MiSeq试剂盒v3

优化的试剂盒提供了更高的簇密度和读取长度,与早期版本相比提高了测序质量分数。

TruSight肿瘤学500

通过一个大型泛癌面板启用CGP,该面板涵盖所有主要变体类别以及FFPE组织的基因签名(TMB、MSI和HRD)。

照亮DNA制备

一个快速、集成的工作流程,用于准备在各种测序应用中使用的库。

工具书类

1.Bruinsma S、Burgess J、Schlingman D等。珠链转座子为NGS文库制备提供了无标准化的工作流程。2018;19:722. BMC基因组学。2018年10月1日在线发布。doi:10.1186/s12864-018-5096-9

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