Shotgun宏基因组测序
什么是Shotgun宏基因组测序？
Shotgun宏基因组测序使研究人员能够对给定复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面采样。该方法使微生物学家能够评估细菌多样性，并检测各种环境中微生物的丰度。Shotgun宏基因组学还提供了一种研究难以或不可能分析的不可培养微生物的方法。
与毛细管测序或基于PCR的方法不同，下一代测序（NGS）允许研究人员并行测序数千种生物体。由于能够在一次测序中组合许多样本并获得每个样本的高序列覆盖率，基于NGS的宏基因组测序可以检测到微生物群落中可能被遗漏或使用其他方法识别成本过高的非常低丰度的成员。
16S rRNA测序 是用于宏基因组学研究的另一种方法。
IDbyDNA Explify平台改善了临床宏基因组学研究的结果
Explify平台是一个完全支持的基于NGS的临床宏基因组学技术套件，适用于临床实验室。观看此视频进行虚拟导览，了解Explify平台如何帮助您的实验室简化流程、改善结果等等。
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Shotgun宏基因组学的建议工作流程
有多种方法可以进行基于霰弹枪的宏基因组测序实验，但这些是工作流程每个步骤的一些建议产品。
点击 下面查看每个工作流步骤的产品。
照亮DNA制备
一个快速、集成的工作流程，适用于从人类全基因组测序到扩增子、质粒和微生物物种的广泛应用。
Nextera XT库准备套件在不到90分钟的时间内为小基因组（细菌、古菌、病毒）、扩增子和质粒准备测序就绪的文库。
TruSeq DNA无PCR文库制备试剂盒
用于全基因组测序应用的简单、全面的文库制备。研究人员可以对各种各样的生物体进行测序，从细菌等小基因组到整个人类基因组。
台式测序
MiSeq系统速度、准确性和简单性，在微生物学中具有深远的应用价值。
NextSeq 1000和2000系统突破性的台式测序仪允许您在各种当前和新兴应用中探索新发现，具有更高的效率和更少的限制。
一个法典
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其他资源
工具书类
- Baker BJ、Sheik CS、Taylor CA、Jain S、Bhasi A等人（2013）群落转录组组装揭示了有助于深海碳和氮循环的微生物。ISME J 10.1038/ISMEJ2013.85。
- McLean JS、Lombardo MJ、Ziegler MG、Novotny M、Yee Greenbaum J等人（2013）使用高通量单细胞基因组学平台从医院水槽的生物膜中回收的病原体牙龈卟啉单胞菌的基因组。基因组研究23:867-77。
- Schofield MM，Sherman DM.（2013）天然产物生物合成原核基因簇的Meta组学特征。当前操作生物技术：10.1016/j.copbio.2013.05.001。
- Neafsey DE（2013）基因组测序揭示了疟疾寄生虫中新出现的耐药性。《自然遗传学》45:589-90。