NGS用于人体微生物组分析
人体微生物组学与Metratranscriptome分析导论
人体微生物组分析是对人体内外微生物群落的研究。人类微生物组分析研究的目标是了解微生物在健康和疾病中的作用。下一代测序（NGS）推动了能够调查整个微生物群落基因组的研究，包括不可培养生物的基因组。
以前，研究人类微生物组样本依赖于时间和劳动密集型的微生物学技术，即培养和分离单个生物体，然后进行表型或基因型分析。使用这些旧方法无法在单个样本中进行微生物群落分析。
微生物转录组学或元转录组学为复杂样本中一组生物体编码的表达RNA提供了关键见解。高质量的元转录组学数据使研究人员能够量化基因表达变化，预测对特定治疗的耐药性或易感性，了解宿主-病原体免疫相互作用，并跟踪疾病进展。
NGS用于研究人类微生物组
下一代测序的出现促成了几个备受瞩目的合作项目，如 人类微生物组计划，该机构使用NGS作为基础工具，发表了大量关于人类微生物组的数据。
NGS方法使科学家能够对复杂的微生物群落进行无培养鉴定和分类。这些方法还可以加速微生物组样本中新物种的发现，并促进毒力和抗菌药物抗性基因的检测。
用于分析人类微生物组的实验性NGS方法包括：
Shotgun宏基因组测序
- 一种DNA测序方法，能够对给定复杂微生物样本中所有生物体的所有基因进行全面采样。
16S rRNA测序
- 一种16S核糖体RNA基因测序方法，用于鉴定和比较给定样本中存在的细菌。
微生物复转录组学
- 分析复杂样本中一组微生物编码的所有RNA。
客户案例
基于转录组学的无偏见微生物分析
了解Diversigen和DNA Genotek的Tonya Ward、Emily Hollister和Le François博士如何开发元转录组学研究的工作流程，并阅读他们对这一研究领域潜在影响的未来的看法。
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rRNA缺失的微生物转录组学
Ribo Zero Plus rRNA耗竭试剂盒在RNA-Seq之前去除rRNA，使您能够专注于转录组的高价值部分。本技术说明展示了微生物分离物和群落样本的rRNA耗竭性能。
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工具书类
- 人类微生物组联盟（2012）人类微生物组研究框架自然48:215-221。
- 秦，李，蔡，李，朱等。（2012）2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联。自然490:55-60。
- 莫里斯CF，海瑟HJ，特恩鲍PJ。（2013）外源性物质塑造了活跃的人类肠道微生物组的生理和基因表达。牢房152:39-50。
- Karlsson FH、Tremaroli V、Nookaew I、Bergstr}m G、Behre CJ等人（2013）欧洲血糖控制正常、受损和糖尿病女性的肠道宏基因组。《自然》498:99-103。
- Penders J，Stobberingh EE，Savelkoul PH，Wolffs PE。（2013）人类微生物组作为抗菌素耐药性的储存库。前微生物学4:87。